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Analyse du GENome des Animaux d'Elevage

Agenae

Projets 2004

Soutenus pour 500 K€

Projets finalisés
Biologie intégrative

  • MUGENE Approche intégrée combinant la génétique, la génomique et la biologie musculaire pour gérer la qualité de la viande bovine selon le potentiel de croissance des animaux et les facteurs d'élevage (JF.Hocquette INRA Theix, UNCEIA)
  • Déterminisme génétique et étude métabolique des problèmes de fertilité des vaches laitières hautes productrices (J.Dupont INRA Tours, A.Malafosse UNCEIA)
  • Geno Milk. Biologie intégrative de la fonction mammaire et adaptabilité de la matière grasse laitière. Impact des facteurs génétiques et alimentaires sur les caractéristiques de la matière grasse laitière et sur les propriétés techno-fonctionnelles des constituants du lait (P.Martin INRA Jouy, K.Duhem CNIEL)
  • Identification du gène et des mécanismes responsables de l’hypertrophie musculaire dans la race ovine “ Texel Belge ” (E.Laville INRA Theix, D.Grasset GEBRO)

Cartographie QTL

  • Une évaluation minutieuse de plusieurs QTL en ségrégation dans les lignées commerciales françaises en vue de leur cartographie fine et de la mise en place d'une sélection assistée par marqueur (D.Milan INRA Toulouse, MJ. Mercat BIOPORC)
  • Combiner l'analyse de liaison et le déséquilibre de liaison pour cartographier finement les QTL dans les pédigrees animaux (B.Mangin INRA Toulouse, APIS-GENE)
  • Cartographie génétique de séquences exprimées chez la truite arc-en-ciel (Oncorhynchus mykiss) (Guyomard INRA Jouy)
  • Cartographie fine de régions QTL des ruminants (L.Schibler INRA Jouy, APIS-GENE UNCEIA)

Protéomique

  • Analyse protéomique de la réponse de la glande mammaire à une infection bactérienne (Génoma II) (G.Foucras INRA, CNIEL)

Projets génériques

  • Génomique des interactions hôte/pathogènes chez les poissons (A.Benmansour INRA Jouy, CNRS/Université Montpellier, Institut Pasteur Paris)
  • Génomique fonctionnelle des cellules souches embryonnaires aviaires (B.Pain INRA-CNRS, Lyon)
  • Intérêt de l'approche e-QTL (QTL d'expression) pour l'identification de gènes responsables de la variabilité de caractères quantitatifs (S.Lagarrigue INRA Rennes)
  • Etude génomique et épigénétique de la réponse immunitaire innée chez le porc (I.Oswald INRA Toulouse)

Projet Séquençage
Une demande a été déposée en réponse à l'appel à propositions 2004 du Génoscope pour que la France participe au programme du séquençage du génome du Porc, qui se construit dans le cadre d'un consortium international. Cette participation s'inscrirait logiquement dans le prolongement des investissements génériques déjà réalisés en France sur ce génome, et notamment :

  • en cartographie physique : création d'une banque de BAC et "fingerprinting" (INRA et CEA, Jouy en Josas), séquençage d'extrémités réalisé au Génoscope,
  • en cartographie d'irradiation : création et distribution internationale d'un panel RH, établissement d'une carte intégrée (plus de 6.000 gènes et marqueurs),
  • maintenance d'un serveur informatique de cartographie (INRA, Toulouse).